核酸提取系列连载(三)
一、DNA提取方法简介——2、非基因组DNA的提取
核酸是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象,因此核酸的提取是分子生物学实验技术中最重要、最基本的操作。为帮助广大科研工作者进一步掌握核酸提取方法并对实验中常见问题进行处理,德航五洲特推出核酸提取系列,相关问题可在评论区留言。
核酸提取系列目录 |
一、DNA提取方法简介 |
二、DNA提取常见问题、原因分析及其对策 |
三、RNA提取方法简介 |
四、RNA提取及其RT-PCR常见问题、原因分析及其对策 |
一、DNA提取方法简介
1、基因组DNA的提取 |
1.1、CTAB法 |
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1.2、SDS法 |
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1.3、其它 |
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2、非基因组DNA的提取 |
2.1、质粒DNA的提取 |
2.1.1、碱裂解法 |
2.1.2、煮沸法 |
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2.2、线粒体、叶绿体DNA的提取 |
差速离心结合SDS裂解法 |
2、非基因组DNA的提取
2.1、质粒DNA的提取
2.1.1、碱裂解法
l 碱裂解法原理
染色体DNA比质粒DNA分子大得多,且染色体DNA为线状分子,而质粒DNA为共价闭合环状分子;
当用碱处理DNA溶液时,线状染色体DNA容易发生变性,共价闭环的质粒DNA在回到中性pH时即恢复其天然构象;
变性染色体DNA片段与变性蛋白质和细胞碎片结合形成沉淀,而复性的超螺旋质粒DNA分子则以溶解状态存在液相中,从而可通过离心将两者分开。
l 碱裂解法流程图
l SDS碱裂解法提取质粒DNA中溶液1的成分及作用
溶液Ⅰ 50mM 葡萄糖 / 10mM EDTA / 25mM Tris-HCl,pH=8.0 葡萄糖增稠,使悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部;EDTA 抑制DNase的活性。这一步溶液中还可以加入RNase,不受EDTA影响,并且可以在后续步骤中被除去
溶液Ⅱ 0.2M NaOH / 1% SDS 破细胞的主要是碱,而不是SDS,所以才叫碱法抽提。
溶液III 3M 醋酸钾 / 2M 醋酸
这一步的K置换了SDS(十二烷基磺酸钠)中的Na,得到PDS(十二烷基磺酸钾)沉淀;SDS易与蛋白质结合,平均两个氨基酸上结合一个SDS分子,钾钠离子置换所产生的大量沉淀自然就将绝大部分蛋白质也沉淀了,同时基因组DNA也被PDS共沉淀。
2.1.2、煮沸法
l 煮沸法原理
染色体DNA比质粒DNA分子大得多,且染色体DNA为线状分子,而质粒DNA为共价闭合环状分子;
当加热处理DNA溶液时,线状染色体DNA容易发生变性,共价闭环的质粒DNA在冷却时即恢复其天然构象;
变性染色体DNA片段与变性蛋白质和细胞碎片结合形成沉淀,而复性的超螺旋质粒DNA分子则以溶解状态存在液相中,从而可通过离心将两者分开。
2.2、线粒体、叶绿体DNA的提取
线粒体和叶绿体是生物体内半自主性细胞器,自身可编码蛋白,它们的比重和大小一定,因而在同一离心场内的沉降速度也一定,根据这一原理,常用不同转速的离心法,将细胞内各种组分分级分离出来。
l 差速离心法原理
是利用物质比重的不同分离混合物的一种方法。
将待分离物质置于均匀介质(蔗糖)中,以一定的转速进行离心,比重大的物质优先沉降,比重小的却处于上层,从而得以分离。
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货号 |
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